Лаба дорогого брата

Какой-то сложный на вид жидкостный хроматограф. Как будто для разделения белков. Знающие люди, подскажите!
Время действия: 2010-е
Место действия: американский университет

Найдена конструкция для синтеза из-за угла.

#Forbidden_lab

Наш постоянный подписчик попросил опубликовать. Не реклама. Сразу скажу что нам не платили за размещение этих материалов. Но мне эта программка показалась как минимум заслуживающей внимания.
Давайте, если под этим постом будет 100 реакций, то я попробую ее лично и дам развёрнутую рецензию.

А пока слово автору:

"Оцените Reactio Draw, новую программу для рисования структур. Она бесплатная, с открытым кодом и работает без интернета. Рассчитана на органиков, но будет полезна всем, кто хочет рисовать структуры.

Что умеет:
- Таблица реагентов прямо по схеме: эквиваленты, массы, объёмы, растворы, чистота, выход. Копируется в Excel
- Быстрое рисование: горячая клавиша на каждую команду, свои шаблоны и сокращения, Clean Up выравнивает всю реакцию
- Анализ: формула, MW, точная масса, HRMS-аддукты, изотопный паттерн, SMILES, InChI
- Предсказание ЯМР ¹H, ¹³C, ¹⁹F, ³¹P без интернета
- Название ↔ структура (OPSIN) в приложениях
- Открывает и сохраняет файлы ChemDraw (CDXML/CDX), а также MOL, SDF, RXN и SMILES
- Вставка в Word и PowerPoint: двойной клик по рисунку открывает его для правки
- Стили журналов ACS, RSC, Nature, Angewandte

Попробовать в браузере без установки:
https://paivel.github.io/reactio-draw/web/

Приложения для Windows, Mac и Linux и исходный код:
https://github.com/Paivel/reactio-draw

Это первая публичная версия, так что шероховатости наверняка есть. Попробуйте на своих реальных схемах и расскажите, что не работает или чего не хватает.

Если программа пригодилась, поставьте ей звезду на GitHub: так её проще найти другим химикам.
Ошибки и идеи пишите в Issues: https://github.com/Paivel/reactio-draw/issues
Там видно, что уже исправлено, и можно обсудить".

Крутой кастомный реактор с кольцевым барботером. Вот именно такой формы должен быть барботер и размещаться строго под лопастями мешалки. Хотя такой и сам по себе может отлично перемешивать.
Глядя на эти шедевры стеклодувного искусства начинаешь осознавать разницу между советскими химиками и нынешними.

УФ детектор от Gilson из состава моего аналитического ВЭЖХ. До того как я его запустил он не работал несколько лет. И по началу я не понимал почему он дает зашкал показывая постоянно 0.6 mAU. Промывал его недели две нон стопом. Думал уже даже купить новую ячейку к нему. А под конец начал просто нажимать на все кнопки и понял что он показывает не сигнал с детектора, а отношение между сигналами двух детекторов. Соответственно разница между 254 и 365 нм у элюента и была 0.6 раза. Переключив эту настройку сразу получил хорошие значения.

Воскресший академик Семёнов смотрит на то во что превратилась академия наук.

После действительно тяжелых прошлых выходных Sponsr триумфально возвращается. Данный проект размещался в двух дата центрах в разных регионах России. И именно эти центры прекратили свою работу из-за вражеских атак. Тем не менее проект сохранил все данные и менее чем за двое суток переехал на новые площадки. Подробности можете прочитать тут.

И на этой неделе у нас будет последний крайний выпуск Лабораторного Бинго! Последний набор из 5 пунктов, которые были в моей американской лаборатории 10-12 лет назад. Есть ли это все в вашей лаборатории прямо сейчас?

Кстати! Впервые в Бинго один из пунктов предполагает не наличие, а отсутствие в лаборатории кое-каких предметов. Догадаетесь о чем речь?

Как никогда я благодарен подписчикам "Соратникам" за поддержку проекта:
ayu
FuriosoSky
Chemicalkub
Ештуков-Щеглов Артур

А также научным блогерам:
Татьяна Голубева
Романыч из лабы

Присоединяйтесь: https://sponsr.ru/laba/

Полупрепаративная колоночка для ВЭЖХ

Масштабирование лабораторного образца до промышленного - самый сложный этап НИОКР. Сложный во многом потому, что на это никто не выделяет денег. Индустрия не заинтересована в чисто лабораторных историях, а на одном энтузиазме не сделать технологию, которая была бы действительно привлекательна для инвесторов.

Рекомендую обратить внимание на Программу трансляционных исследований, которую запускает Центральный университет. Это инициатива для научных команд, которые хотят превратить результаты своего исследования в работающий прототип для реального сектора.

⚡️Сейчас открыт конкурс на годовую программу поддержки. Заявки можно подать до 1 декабря. Для этого руководителю научной команды нужно заполнить форму на сайте.

Программа ориентирована на проекты по восьми приоритетным тематикам — от новых материалов, переработки сырья и оптимизации производственных процессов до ИИ для науки, ритейла и образования.

Что получают участники:
➡️ до 5 млн рублей на 1 год;
➡️ доступ к бизнес-заказчикам и реальным технологическим запросам;
➡️ менторскую поддержку экспертов индустрии и технологических предпринимателей.

Успейте подать заявку до 1 декабря по ссылке

Перегоним ваши растворители. Много.

#лаборатория_по_четвергам

Бывало что запасали вещества прям на века, на всю жизнь запасали. Так сказать чтобы два раза не синтезировать.
Кстати, угадаете что за вещество в банке?

В комментариях к предыдущему посту вспомнили про цирконий.
И мне напомнили историю, как у коллеги в лаборатории была банка цикория, который она пила. И все кто видел эту банку читал название исключительно как "цирконий".

Так уж устроен наш мозг. Вы химик, вы химической лаборатории и видите банку с надписью "ци... что-то там". Ну конечно же это цирконий, мозг даже не пытается прочитать.

И то что на банке была изображена кружка никак не влияло на восприятие.

Варим цинкорганику.

#Forbidden_lab

Третьего дня приснился сон. Как и все сны он был довольно сумбурным, но основную мысль я попытаюсь вам пересказать. Вобщем я синтезировал какую-то новую молекулу. И ради способа ее получения за мной начинаются охотиться то ли террористы, то ли шпионы. И после длительных погонь и перестрелок меня ловят и заставляют отдать методику. А я спрашиваю зачем им это вообще нужно? А мне отвечают что в статье в Журнале органической химии было написано, что это соединение может обладать противовирусными свойствами!
Воющем я начал смеяться еще во сне, потом проснулся и продолжил смеяться дальше.
Это же надо было придумать чтобы в статье писать "может обладать какой-то там активностью" не имея никаких на то результатов. 😂

Соскучились по рубрике #лаба_с_озона? Да?
Ну тогда вот вам очередная годнота! Для начала попробуйте без подсказок угадать что рекламирует эта картинка?

Ну а потом можете пройти по ссылке и заказать простую, но полезную в каждой лаборатории штуковину: https://ozon.ru/t/3QzAn9q

Итак статья о которой мы писали несколько дней назад опубликована в виде препринта и с ней можно познакомиться по ссылке: https://chemrxiv.org/doi/full/10.26434/chemrxiv.15010060/v1

Ну а далее слово автору: "Главная мысль статьи: спектр не подгоняют под структуру, его объясняют целиком!
Работа начинается с отозванных статей по химии. Из 72 621 записи базы Retraction Watch после фильтрации осталось 504, все они были просмотрены, и в итоге отобраны шесть работ, где неверная структура была установлена по данным ЯМР. Они опубликованы в J. Am. Chem. Soc., Nat. Commun., Org. Lett. и Chem. Commun., (я специально искал высокорейтинговые, чтобы посмотреть какие работы проходят рецензирование в топ журналы) и отдельно обсуждается, почему такие ошибки проходят рецензирование.
Во второй части дана теория: что нужно делать, чтобы уметь читать спектры ЯМР. Это не общее введение в метод, а только то, что нужно, чтобы прочитать опубликованный спектр: химический сдвиг и константа спин-спинового взаимодействия, оценка разрешения по опубликованному спектру, в том числе по сигналу остаточного растворителя, и условия, при которых применимо описание первого порядка и как оно связано со спиновой системой. На этом основаны все дальнейшие разборы и итоговый чек-лист.
Далее разбираются шесть случаев, в которых анализ привёл к неверной структуре: три подробно, а три оставлены вам как читателям в роли коротких задач. Для каждого показано, что говорят опубликованные данные, что не было измерено и где можно было заметить несоответствие, а в конце сведены общие для всех шести выводы.
Отдельно рассмотрен случай, когда структура верна, а её описание нет: опубликованная работа группы Скотта Миллера (Йельский университет, глав ред JOC), разобранная по приложенным исходным спектрам. Разбор обсуждался с профессором Миллером в переписке. Здесь же вводится различие между «кажущимися» (app) и «уширенными» (br) сигналами и обозначение вводится понятие Japp.
Завершают работу чек-лист для авторов и рецензентов, сравнение автоматических инструментов, включая большие языковые модели, которые копируют описания, с инструментами, которые их проверяют, и рекомендации о том, что разумно требовать от Supporting Information. Заканчивается обзор ответом на вопрос, вынесенный в заголовок - почему важно понимать спектры.
В Supporting Information приведены методика отбора отозванных статей, полный разбор трёх задач и полное отнесение сигналов пары мономер–димер по одно- и двумерным спектрам.
По поводу школы и где я обучался, можно прочитать из Acknowledgements".

Мы будем следить за судьбой этой публикации и если когда она выйдет в виде полноценной статьи, то обязательно сообщим и дадим ссылку для цитирования.

Фотография современной мешалки в заброшенной лабе навела меня на определенные мысли. А недавно еще добавил эмоций вот этот пост с упавшим светильником.
Поэтому в завтрашней статье на Спонсоре я буду разбирать возможные причины, которые мешают нам покинуть бесперспективную работу.
Статья выйдет как обычно в воскресенье в 12:00.

Подписчики базового уровня получают не менее одной большой статьи каждую неделю. Также есть много бесплатных материалов для ознакомления.

Присоединяйтесь к сообществу на https://sponsr.ru/laba/

Смеситель/диспергатор от IKA. Штука довольно специфическая, но как более технологичный вариант ступки с пестиком - сойдет.

Перед нами ультрацентрифуга Beckman L5-65. Никаких сенсорных экранов: только аналоговые шкалы, механические регуляторы и лампочки.

Настоящий пульт управления космическим кораблём! И ведь такая техника до сих пор работает.

А вам ближе аналоговые приборы или современные цифровые?

#лаборатория_по_четвергам

Я прочитал подпись к картинке и первая мысль: "опять за какую-то парашу дали премию по химии!"
А потом решил почитать подробнее. И оказалось что это просто подпись до безобразия бездарно сделана.
А премию дали за то что они разобрались как делать энантиомерно чистые вещества с высоким выходом. Вобщем ситуация когда в молекуле есть хиральный центр и один энантиомер лечит, а другой калечит встречается довольно часто (про талидомид вам какой-нибудь мамкин научпопер расскажет или загуглите). Благодаря лауреатам по химии 2026 года теперь успешно делают разные сложные лекарства. Вот как-то так.

Издержки работы в "заброшках". В тяге рухнул светильник. Разбил колбу в которой был тионил хлорид. Наружу вырвался едкий газ.
P.S. дырка в боковом стекле появилась за долго даже не до этого падения, а до моего прихода в лабу. Но я первый кто предложил заклеить ее хотя бы скотчем, раз уж заменить его невозможно.

Классическая стеклодувная мастерская и станок для разметки посуды, видавший виды.

#Forbidden_lab

Делить на колонке бромпроизводные то ещё удовольствие...

У Русхима есть офлайн магазинчик в Москве. Посуда по вменяемой цене и распродажа реактивов. Расположение конечно такое себе. Вход через хостел и все такое прочее. Но в случае чего можно сэкономить много времени, если вы живете в Москве конечно.

Красота в глазах смотрящего. Я бы, например, поменял последние две картинки. Часто хорошие работы бывают написаны в виде уродливых поделий-черновиков. И только после качественной работы рецензентов получаются приятные глазу вещи.
Поэтому если вам кажется что рецензент изуродовал вашу статью, но это на самом деле может быть совсем не так. Но может быть и именно так.

Завтра в 12:00 на https://sponsr.ru/laba/ выйдет моя статья "Нельзя пытаться вести бизнес работая как в науке". Тема зарабатывания денег за счет научных разработок не сходит с повестки. Поэтому мы поговорим почему подходы (иногда это даже вполне хорошие подходы), которые мы используем в научных лаборатория нельзя переложить на бизнес-проекты.

Выражаю огромную благодарность всем платным подписчикам на https://sponsr.ru/laba/ и особенно "соратникам":
ayu
FuriosoSky
Chemicalkub
Голованов Александр

Также благодарю других научных блогеров за поддержку проекта:
https://t.me/tatiana_biologist
https://t.me/chemistryfromLaba

Присоединяйтесь к сообществу: https://sponsr.ru/laba/

Крепление шланга к форвакуумному насосу для ГХ-МС. Мне всегда нравилась эта пружина в шланге предотвращающая его схлопывание.